Nazwisko zostało utworzone od rzeczownika pospolitego kowalik (gatunek ptaka lub owada) i wskazuje na charakterystyczną cechę nosiciela. Nazwisko może również pochodzić od imienia Kowal i zawierać patronimiczny sufiks -ik, wskazujący na związek z ojcem lub innym przodkiem, który tak się nazywał. Wariant: Kowolik.