Priezvisko vzniklo z krstného mena Mikuláš a odkazuje na spojenie s otcom alebo iným predkom tohto mena. Základom priezviska bol skrátený slovenský tvar Mi- ku ktorému sa pripája prípona -ko. Môže pochádzať aj zo stredovekého maďarského mena Mikó (hypokoristická forma maďarského krstného mena Miklós alebo Mihály; pravopisná adaptácia). Variant: Mikó.